Национальный научный центр хирургии основан в апреле 1945 года на базе госпиталя для ветеранов и инвалидов 2-ой мировой войны и в числе первых научно-исследовательских учреждений вошел в состав Академии наук Казахской ССР. Его основателем и первым директором (до 1975 г.) был видный ученый, талантливый хирург, заслуженный деятель науки  Каз ССР, академик АН КазССР Александр Николаевич Сызганов.

Национальный Научный Центр Хирургии им. А.Н. Сызганова является ведущим многопрофильным медицинским учреждением в стране, где оказывается лечебно-диагностическая помощь по самым современным технологиям. По отдельным направлениям хирургических вмешательств, ННЦХ им.А.Н. Сызганова является передовой медицинской организацией, известной за пределами Республики Казахстан.

Основными направлениями деятельности  Национального Научного Центра Хирургии им. А.Н. Сызганова, являются:

Сердечная хирургия, включающая:

• хирургию врожденных пороков сердца
• хирургию приобретенных пороков сердца
• коронарную хирургию при ишемической болезни сердца
• интервенционную кардиологию (стентирование, аритмология, установка окклюдеров)

Сосудистая  хирургия, включающая:

• хирургию артерий всех калибров
• хирургию венозной патологии
• эндоваскулярную хирургию
• лазерную деструкцию гемангиом

Реконструктивная и пластическая   микрохирургия, в том числе

пластическая  и эстетическая хирургия

Легочная хирургия, включающая:

• хирургию врожденных и приобретенных заболеваний легких и средостения
• заболевания и травмы плевры и дыхательных путей

Детская хирургия

Трансплантация органов и тканей

Общая плановая  хирургия для взрослых и детей, включающая:

• хирургию пищевода и органов средостения
• хирургию печени, желчных путей и поджелудочной железы
• хирургию желудка и кишечника
• эндовидеохирургию
• хирургию эндокринных желез

Лечение заболеваний ЛОР-органов (хирургическое, эндоскопическое, консервативное)

Гипербарическая оксигенация (барокамера)

Оперативная гинекология при воспалительных и опухолевых заболеваниях  малого таза и  женском бесплодии

Урология и андрология

Стоматология (терапевтическая и хирургическая)

Консультации ведущих специалистов по различным отраслям медицины, в том числе (нефрология, неврология, эндокринология, кардиология)

Функциональная и лучевая диагностика (эндоскопия, электрокардиография, эхокардиография, УЗИ всех органов и систем, включая сосуды, компьютерная и магнитно-резонансная томографии, спирография и др.)

Весь спектр клинико-лабораторных исследований (включая ИФА и ПЦР при гепатитах, онкозаболеваниях), бактериологические исследования

Морфологические исследования (биопсия с гистологией, цитология, электронная микроскопия).