ТОО «Казгидро» является членом Ассоциации «Гидропроект» и Союза инженеров-энергетиков Казахстана. Ведется сотрудничество с казахстанскими, узбекскими, украинскими и российскими проектными и научно-исследовательскими организациями. Основные казахстанские организации, с которыми ведется совместная работа: ЗАО КазНИПИИТЭС "ЭНЕРГИЯ", ЗАО "Институт "КазНИПИЭнергопром", ПК "Институт "КазГИПРОВОДХОЗ", ТОО «Квант-1», АО "Казсельэнергопроект", АО «КазГипроНефтеТранс», ТОО «ЭлПс проект плюс», ТОО «Sustainable Ecology Development», ТОО «Су проект», институт «Казаэропроект», Консорциумом во главе с Китайской Международной корпорацией Водного Хозяйства и Энергетики (CWE), Чэндуским проектно-изыскательским институтом (CHIDI).